上海国际航运研究中心于2008年7月14日正式成立，上海市委副书记、市长韩正发来贺信，交通运输部副部长徐祖远、上海市副市长沈骏共同揭牌。研究中心由上海海事大学、虹口区人民政府等10多家单位共同发起，经上海市教育委员会批准，得到上海市建设和交通委员会支持。2014年被列入上海高校人文社会科学重点研究基地建设计划。
